幽冥女王之兄阿達武士（Rito）加入侵略地球的隊伍並壓倒性的擊敗金剛戰(zhàn)士摧毀了大連王與戰(zhàn)鬥白虎指揮中心亦在戰(zhàn)鬥中損毀金剛戰(zhàn)士就此失去超異能宙威利用中心所餘的能量將失去超異能的戰(zhàn)士們送去忍者神廟要他們?nèi)ヒ娍裳u造超異能硬幣的忍者戰(zhàn)士（Ninjor）儘管途中有阿達武士派遣的食人鳥追擊但戰(zhàn)士們依舊成功抵達神廟獲得新的超異能並多了忍者裝扮的變身型態(tài)以及忍者機械獸（Ninja Zords）後來巴布猴、怪頭陀與魚匠人等尋獲失落已久的無敵戰(zhàn)將（Shogun Zords）玄冥大帝等人遂奪走小晴的超異能硬幣與大明的戰(zhàn)鬥鷹企圖要脅金剛戰(zhàn)士替自己駕駛無敵戰(zhàn)將征服地球大明只得潛入暗月宮內(nèi)於千鈞一髮之際奪回硬幣與戰(zhàn)鬥鷹而比利亦在操縱無敵戰(zhàn)將時將控制權(quán)奪來令玄冥大帝的企圖失敗也讓金剛戰(zhàn)士多了五架新的生力軍 小晴為了追求理想決定離開參加體操大賽訓(xùn)練原先遭幽冥女王下咒以企圖謀害金剛戰(zhàn)士的凱特（Katherine）在破除魔咒後取代她成為新的粉紅戰(zhàn)士但過沒多久幽冥女王的父親終極魔王發(fā)動魔法將時間倒轉(zhuǎn)令金剛戰(zhàn)士全回到童年時期因此失去了超異能為了抵禦侵略宙威自水柔星請來了外星戰(zhàn)士第三季就此進入特別篇至於變回兒童的各戰(zhàn)士除了比利透過機器很快恢復(fù)之外其餘人則到各地尋找奇奧水晶的碎片希望將之收集後發(fā)動魔力令地球恢復(fù)原狀而伊莎到非洲尋找水晶時意外與遠親相逢從此留在當(dāng)?shù)?由表姊唐娜帶著水晶回到美國但當(dāng)水晶湊齊讓地